La historia de la creación de la beneficencia se remonta al año 1819 cuando el Virrey Pezuela crea la primera Junta Real Beneficencia de Lima. En 1825; cuando la independencia del Perú ya era una realidad, se crea la Dirección General de Beneficencia de Lima y se le dota de rentas.

El 17 de setiembre de 1836, mediante decreto expedido por el protector de la confederación Peruano Boliviana, Mariscal Andrés de Santa Cruz, se dispone a través de la ley de 1834, que las Beneficencias se constituyan en las capitales de departamento, es así que en 1849 se crea la Sociedad de Beneficencia de Puno, a solicitud de la prefectura de aquel entonces. Desde entonces la sociedad de beneficencia de Puno ha entrado en funcionamiento y viene buscando trabajar, proteger y brindar calidad de vida a los adultos mayores, menores y madres en riesgo Social.